国民政府审理战犯，虽以"宽大"为宗旨，指示"若无重大之罪证者，予以不起诉处分，释放遣送返日""战罪嫌疑犯中无罪证者，应尽速遣送回国"⑥，但对犯罪事实确凿的战犯，还是严惩不贷。
如广州审理日军宪兵杀害国军12名情报人员一案，判处松永平司大尉等三人死刑。曾任关东军参谋长、香港总督的矶谷廉介，因策划侵略中国东北等罪行，被判处无期徒刑。大屠杀主要参与者谷寿夫、井敏明、野田毅等，都被判处死刑。
