战争期间，保护日本"间谍侨民"
甲午战争期间，中美之间围绕日本间谍问题进行多次交涉，美国偏袒日本的态度尤为明显。战争硝烟蜂起，中日两国相当关注侨民保护事宜。按照国际惯例，两个国家外交关系破裂，发生战争，可委托第三国代为保护侨民之合法权益。1894年8月1日，中日正式宣战，双方都委托美国代为保护侨民。美国偏袒在华日本侨民，对所保护的"日本人"并无严格的定义和区分，致使日本奸细乘虚而入，违背国际法公约，引发了中美之间一系列的日本间谍案的交涉。
首先是日本间谍石川伍一案。1894 年8月4日，日本间谍石川伍一在天津被捕。美国宣称"遇有日本人改装在内地作奸细者"，即"将其解交就近海口，逐其回国，使之不得与内地华民交接，"即"已足以惩罚其作奸细之罪"。暗示清政府对日本奸细最重的责罚只能是驱逐出境，因为日本间谍"于中国防泄军纪似亦无大碍"。显然，美国以日本间谍对清政府军事备战危害性不大为借口，要求从轻处罚日本间谍，"本仁慈之心, 不因两国失和, 于日本人民恨恶而深绝之可也"。清政府当即予以反驳，宣称在中日战争已经正式开始的情况下，"战守机宜，关系慎重"，"日本奸细改装髻发，混迹各处，刺听军情，实与战事大有关碍"。因此，美国提出处理日本奸细的建议，"实不足以惩其作奸之罪，亦与公法不符"。8月29日，美国驻华大使田贝直接致电李鸿章，否认石川伍一是日本间谍："据日本国家称：石川伍一并非奸细，应请中堂开放，送交驻津领事转饬回国。"但清政府已然掌握了石川伍一的确凿罪证，9月2O日，石川伍一被解往校场依法枪决。
