此时，迂回的人民解放军不费吹灰之力便攻克了类乌齐，随后又进行急行军，目的在于赶到十字路口处切断阿沛的退路。藏军官兵在天黑以后沿着险峻而狭窄的小道急速向拉贡山关推进，于当晚10时到达拉贡山关。从山关下到山脚他们又花费了3个小时，从山麓到拉贡昂达还需要走几个小时，此刻，每个人心目中所考虑的问题都是解放军是否已经到了十字路口。阿沛派了几名随从骑马前去侦探此事，得到的情报是：中共军队早在几个小时以前就已到达拉贡昂达。实际上，类乌齐刚被攻占，解放军第154团的约100名骑兵和步兵便以每天约50英里的行程全速向前推进。藏军的退路已被切断，阿沛决定与其进行无效的抵抗不如缴械投降。他命令全体人员退到附近的祖古寺，并委派森本堪布和卡日巴去找解放军，表示愿意投降。他们刚出发没多久便碰上了一支解放军侦察部队，于是便把他们带到了祖古寺。他们带来了一柄表示投降的剑，具有讽刺意味的是，到后来他们竟拿不出象征投降的东西了。1950年10月19日，解放军俘虏了阿沛及其手下的全体藏军2700多人，缴获了大量武器。
此时，解放军用肉食和蔬菜款待聚集在祖古寺的藏军官兵，让他们饱餐了一顿，并对这些西藏人说，他们的使命和职责是友好地款待他们而不是伤害他们。随后西藏官员们都被送回昌都，被拘留关押起来，而藏军士兵则每人领到一个大洋然后让他们解甲归田。歼灭了藏军主力部队之后，解放军长驱直入，没有遭到任何抵抗。10月22日，解放军攻占了洛隆宗；10月27日，攻占硕般多；10月31日，解放军攻克了边坝宗。
昌都战役历经19天，先后打了20多仗，共歼灭藏军5700余人，计有5个代本全部，3个代本大部。1个代本起义。俘虏代本以上高级官员20余名，俘获在藏军中服务的英国人福特、柏尔及2名印度人。
中央人民政府从一开始就希望以和平的方式解放西藏，昌都战役显示了解放军无可匹敌的战斗力，也消灭了西藏当局手中唯一可战之兵。昌都战役后，西藏上层统治集团一片混乱，摄政达扎不体面地下台，达赖喇嘛提前亲政。达赖亲政后，即于1951年2月派出西藏地方的全权代表5人前往北京与中央人民政府进行谈判，再次打开了和平之门。
