到10月16日，解放军的两支部队，一支从芒康，另一支从江达向前推进，如人无人之境。这时藏军无力抵抗，准备弃城西撤。此时，撤退的道路还没有被切断。16日傍晚，从类乌齐来的一位信使带来了解放军正接近该镇的消息，昌都与拉萨的交通即将被彻底切断，于是阿沛便请求拉萨当局准许其缴械投降或率部撤退。次日，拉萨方面发来了要他率部撤退的命令。到了17日，阿沛召集手下的官员们说，如果不马上离开昌都，就会成为解放军的俘虏。除留下少量军队焚毁军火库，阿沛及其他官兵在天亮之前离开昌都。
英国人福特描述了18日早晨7点钟的昌都的情形："整个昌都城人心惶惶，惊恐万状。人们向四面八方逃跑，有的携带着自己的财物，有的拖着有用的物品……大街上的牛栏马棚已无人照料了……随后，被招募来的一小群康巴民兵奔跑着穿过街道，边跑边愤怒地呼喊，满脸杀气……"当福特骑马返回昌都的闹市区他的无线电台所在地时，碰上了赤门代本的两名如本，他们对福特说："赶快骑着马逃跑吧……你不能返回昌都的闹市区，假如你想这样做，他们会杀死你！"
