罗瑞卿受到毛泽东的表扬，引起了林彪的嫉恨。一心要爬上权力宝座的林彪，把罗瑞卿看成他在军内强有力的竞争对手。而且，林彪长期以来在军内推行个人崇拜，罗瑞卿对此持反对意见。1960年，林彪抛出"顶峰论"和"最高最活"等极"左"口号，罗瑞卿当即针锋相对地指出："难道马列主义、毛泽东思想就不再发展了吗？把革命导师的理论说成'顶峰'，这本身就违背了毛泽东思想。""'最高最活'，难道还有次高次活？毛主席知道了也不会同意。"
1961年，林彪又提出"背警句"、"立竿见影"等口号时，罗瑞卿明确表示自己同意罗荣桓元帅的观点，尖锐地指出，死背硬记，从书本中找现成答案，搞"立竿见影"，而不去认真学习毛主席著作的精神实质，这种学习方法违背了理论联系实际的革命作风。在战略方针上，林彪主张消极防御，说："不要看地形，看地图就行了。"而罗瑞卿反驳说："地图要看，地形也要看，打仗不熟悉地形是不行的。"
