经过批准，3月17日上午，邓小平召集习仲勋和李维汉等开会，研究《新疆民族区域自治实施计划(草案)》。27日，邓和习、李书面报告毛泽东并中共中央，提出重要建议：第一，基本同意《新疆民族区域自治实施计划(草案)》。第二，在新疆推行民族区域自治，是一件极为重大的事情。因此，"必须加强党的领导，充分做好准备工作"。可在土改基本结束后，先从维吾尔族以外的其他少数民族聚居区着手推行，取得经验，而后逐步完成全省范围的区域自治。第三，在进行民族区域自治及有关民族政策的宣传教育过程中，"必须强调贯彻爱国主义教育。务使干部和群众对伟大祖国能有正确的认识，对毛主席的民族政策能有更深刻的体会"。
第四，维吾尔族在新疆如同汉族在全国一样，在各兄弟民族中是多数，是主体民族。因此，"必须教育维吾尔族干部如同汉族在全国范围内团结、帮助和照顾各少数民族一样，来团结、帮助和照顾新疆境内的其他少数民族"。第五，新疆自治区(1955年成立时名为新疆维吾尔自治区)仍应相当于省级，与内蒙古自治区和西藏(1965年西藏自治区正式成立)一样均直接受中央领导，并受大行政区行政委员会的督导。第六，新疆改名"天山"不完全切合实际，以不改为妥，全称为"新疆自治区"。报告说明："仲勋同志又与赛、包研究"，"经再次深谈，已表示接受。""后仲勋告包、赛，成立新疆自治区是明年的问题，还可继续研究，目前暂不以此名称问题在于部中讨论，免得把大家的注视引向不关主要的争论上去，此一点，包、赛都赞成。"
