中美合作所的合作方式其实就是中国出力，美国出钱。1941年12月3日，国民党军统情报部门就破译了日本准备偷袭珍珠港的一份特级密电。当这个消息呈递给蒋介石以后，蒋十分震惊，立刻向美国方面通报，但美国国内孤立主义情绪高涨，罗斯福总统并未重视这份情报，美方不但不相信这份情报，还认为中国有意挑拨日美关系，在偷袭珍珠港造成美国巨大损失后，美国才决心与中国建立情报合作。中美合作所建立后也不负美国所望，为美国海军提供了大量重要的情报，在太平洋战争后期，中美合作所根据截获的情报帮助美军将伪装的残余日本军舰找出，使美军成功"夷平"日本军舰群，此举得到了美国总统罗斯福发函中国政府致谢。连日本人至今仍引以为傲的英雄"联合海军司令官"山本五十六(山本后来成为日本人反复拍摄的海军战争电影题材)，也是因为中美所截获其出巡的情报而被美国空军袭击身亡，导致日本海军痛失大将。中美所自1943年成立后，平均每日截获日军电报高达450份以上，以1944年9月至第二年8月为例，一年间总共截获密电11万余件。
