在中西功不幸被逮捕后，日本军国主义者愤怒地批判中西功，称他的行为"出卖了日本国家利益"。如果说军国主义者对反法西斯战士的愤怒可以理解，但在今天的中国国内，竟然也有个别人附和日本右翼，称中西功和他的同志们是"标准的日奸"。对于这样的声音中西功是如何回应的？
在接受审判时，中西功列举了掌握的大量国内数据，说明了侵略战争持久的前景必然是经济崩溃和彻底战败，日本国家和日本人民将因为侵略战争而万劫不复，以辩证唯物主义的态度证明了在二战期间，反对侵略战争就是日本最高的国家利益所在。在东京法庭上，中西功反驳"叛国罪"的指控时说："制止日本侵华战争，能使日华人民从毁灭性的灾难中解脱出来，实现日华和平和日华人民世代友好，这是两国人民的莫大幸福和根本利益所在。"从这个角度看，中西功不仅是一个英雄的国际主义者，更是一个伟大的爱国主义者。不把"日奸"的名头按在昭和军阀而是扣在中西功等日本同志的头上，是一种极为荒谬的观点。
1944秋，日本法庭判处中西功死刑。宣判书以惊叹的语言称："彼等不怕牺牲，积极努力，用巧妙之手段，长期进行侦察活动，其于帝国圣业、国家安全、大东亚战争及友邦胜负，危害之大，令人战栗。"
但幸运的是，死刑并没有马上执行，据说是因为中西功在被判刑的同时开始写《中国共产党史》。中西功在书中展示了他极高的知识水平，翔实的资料和严格的逻辑分析让"特高课"十分感兴趣，于是准备让他写完了再处决。谁知中西功越写越多，还点名要求同判死刑的西里龙夫合作撰写。虽然《中国共产党史》直到1945年8月15日日本投降还是没写完，但中西功和西里龙夫却因此亲眼看到了日本法西斯的最终失败，两人也于不久后出狱。
