在沦陷区，国民政府的主要措施是设置"教育指导区"。1938年，沦陷区9省4市曾设置50个"教育指导区"，派遣大批教育干部赴沦陷区从事公开或秘密的教育活动。随着战争的推进，"教育指导区"不断增加至18省6市102个之多。"指导区"的主要工作，是联络、吸收敌占区的仍忠于国家的中小学教师，借以消灭奴化教育。
1940年，国民政府还特别通过《津贴沦陷区中小学教师办法》，对沦陷区内暗中为国家服务的中小学教师给予津贴补助。接受津贴的教师须宣誓效忠国家，其誓词如下："我是中华民国的国民，矢志尽忠国家，遵守政府法令，拥护抗战国策，绝对排除奴化教育，不作教育界败类，遗羞子孙。如违誓词，愿受政府最严厉的处分。"同时，教育部还特别制订了沦陷区中学毕业生升入大后方大学就学的规定。1936年在校中学生为48万余人，正因为当局的努力，至抗战结束，在校中学生数量不降反增至120余万。
