在济南被攻破后，王耀武被华野抄了家，然而只搜出两台拖拉机。王耀武回答说是国外友人送的，等国家太平，回家务农用的。陈毅等人听后，颇为感慨。
1959年，王耀武与杜聿明、宋希濂、溥仪等10人获得第一批特赦释放。幸得周恩来的关心，六十年代与北京的一位中学女教师共结连理。可惜好景不长，不久文革了，以王耀武的历史背景，一顶历史反革命的帽子扣个正着，他不时被红卫兵拖出去批斗、陪斗。1968年某日，他被拉去给康泽陪斗，康泽这历史大特务在台上被红卫兵用皮带、棍棒打得半死，王耀武虽然稍好些，也大受惊吓，再加他本来身体就不大好，回家之后高烧数日不退。一代名将王耀武就此命休，他的妻子也跟着倒霉，作为反属备受欺凌，后来不堪迫害而发疯致死。
文革结束后，统战部、全国政协在1980年7月为王耀武和溥仪、廖耀湘三人补开了追悼会。王耀武的骨灰存于北京八宝山公墓。
