该计划有严格的安保措施，据称当时"国光作业室"设有保防官，有特殊而严密的保密规定，即使同属一处的参谋，如果不是奉命参与同一计划的制订，也不能询问或打听相互承办的计划，所以相互之间根本不知道所研究的内容。
保蒋困蒋：美力阻"国光计划"实施
上世纪50年代，美国虽然与台湾签订《共同防御条约》，在台湾驻有军事顾问团，美海军的航空母舰在台湾海峡游弋，给予台湾大量的军援装备物资，并协助训练 国民党军队。但是，美国出于自身战略利益的考量，坚决反对蒋介石反攻大陆，认为国民党反攻大陆不仅不可能成功，反而可能因此丧失台湾这块基地。
因此，驻台美军和情报人员极尽所能地搜集相关的情报，希望发现蒋介石准备"反攻大陆"的蛛丝马迹，并加以阻止。据朱元琮将军回忆，美国也曾风闻蒋介石的 "国光计划"，并暗中进行侦探。1951年7月上旬，在一次酒会当中，美国顾问团团长戴伦突然询问台"参谋总长"彭孟缉，为什么台空降团及陆战队不按年度 计划训练，且兵工厂日夜加班修理武器？在同年的8月9日，美顾问团的成员不顾台宪兵的阻止，硬闯属"国光计划室"中位于三峡阳明营区的"成功计划室"查 看，并派直升机飞抵上空进行盘旋侦察。同时，美在台湾海峡的巡逻舰只，密切跟踪台湾外岛的补运船只，而陆战队的美籍顾问还每周清点两栖登陆车的数量。
