"权力只对权力的来源负责"，御史由皇帝任免，直接对皇帝负责，不受同级、上级行政长官的干预，甚至不受御史台长官左右。御史出巡回京，"或露 章面核，或封章奏核"，直接向皇帝汇报，无须经台主转呈，哪怕台主转呈也不能拆阅。同时，皇帝还赋予御史"大事奏裁，小事立断"的尚方宝剑，在特殊情况 下，御史可以"便宜从事"，先斩后奏。
为了避免御史行使职权受干扰，在组织编制和地位上，御史台与行政、司法、军事等部门平行而立，不受其他部门管辖，完全独立，自成体系。比如唐代御史台下设台院、殿院、察院，分工监察，各负其责。
对地方官员的监察也是如此，由中央派出御史（不同朝代称谓时有不同）到地方，设立派出机构，垂直管理。比如汉代的十三刺史，是中央派出官员，设 立州衙门，不受地方管辖节制，刺史的官秩只有六百石（相当于低级县令），却敢以贱察贵，监督二千石的郡守，刺史"到所部，郡国各遣一吏迎之界上，所察六 条"。
