李登辉的言论也遭到民进党大佬吕秀莲批评。吕秀莲2012年10月受访时表示，李不应该说钓鱼岛属日本，称李是不清楚钓鱼岛议题，才会相信日本的说法。
除钓鱼岛问题外，李登辉在触及东亚各国敏感神经的"靖国神社"议题上也语出惊人。2010年，李登辉曾表示，台湾人也应该到日本靖国神社参拜。此言遭到台湾民意代表批评。
