赤瓜礁海战前，虽然我国一直严正宣告拥有南沙群岛的主权，但实际上并没有有效控制其中任何一个岛屿、珊瑚礁或沙洲。此次海战后，我国控制了南沙群岛的永暑礁、华阳礁、东门礁、南薰礁、渚碧礁、赤瓜礁共6个岛礁，填补了中国对南沙群岛实际控制的空白。1994年，南海渔政部门进驻美济礁，进行有效管理，中国内地在南沙群岛的实际控制岛礁数目达到7个。
