但是日本分析，日军也要克服诸多困难，首先是四川基本上没有公路，分布着大量垂直山崖，地形非常复杂。日军压制火炮都难以进入四川，只能使用轻型火炮，还必须要分解开由骡马驼载，后勤保障同样非常困难。
第二点是，关东军反对，不愿意抽调部队南下，海军同样反对，称现在应该以对美国作战为中心，并与之进行正面决战，决不能分散国力。陆军参谋部的意见是，战役规模太大，如果想进攻四川，就必须消灭掉在湖北湖南的100个中国师。而现在陆军缺乏船只和石油，没有能力维持和保障进行如此大的军事行动。
尽管日本对于中国战局，畑大将一贯坚信"必须依靠武力摧毁重庆政权，打开大东亚战争的突破口，舍此无它"。但是，日本陆军和海军高层还是为了在南太平洋向美军发起反击，开始抽调准备进行重庆战役的部队南下。
