革命胜利后，郭元亨终于迎来了自己的新生。因为他救助红军有功，也因他把自己保存多年的榆林窟道观镇观之宝--象牙佛捐献给国家(现保存在国家博物馆)，甘肃省政府决定对郭元亨按月发给工资和口粮，敦煌文物研究所聘请他为榆林窟文物管理员，享受国家干部待遇。在此前后，他还分别当选为甘肃省人大代表和甘肃省政协委员。
尤其令他感动的是，通过联系，1961年12月，时任中国人民解放军装甲兵副司令员的程世才中将写信给他，感谢他在20多年前红军路过万佛峡时对革命的帮助。同时，装甲兵政治部还致函安西县政府说，"在革命艰苦的岁月里，郭元亨老先生帮助了红军，实为可贵"。
作为一个曾经支援过中国革命的宗教界人士，郭元亨在新中国成立后得到了人民政府的多方关照，安度晚年。1976年7月8日逝世，享年80岁，安葬于安西县踏实乡南戈壁。今日蘑菇台上，当年的道观旁边，建有一座西路军纪念馆，里面陈列着郭元亨道长生前用过的一些物品，以及程世才将军和装甲兵政治部1961年的两封来信。
