而日军方面，虽然攻占了武汉，但也付出了不小的损失，而且中国依然没有屈服，还在坚持抗战。占领武汉等地后，日军所控制的地区越来越大，这就更应了冈村宁次的名言"敌非敌，地形是敌，征战我不爱山水"，中国广阔的地域面积就是一个深不可测的无底洞，本来兵力就不足的日军，由于战线的延长，兵力更加捉襟见肘。从此之后，除了在1944年孤注一掷地组织"一号作战"外，就再也无力组织像淞沪、徐州和武汉会战这样大规模的、以攻城略地为目标的战略性进攻，抗战也从战略防御阶段逐渐过渡到战略相持阶段，日军开始则越来越深地陷入了持久战的泥淖之中。
此外，日本除了兵力不足以外，为了维系日益扩大的军队，国内资源也已经逐渐枯竭，武汉保卫战时日军甚至连军校学员的步枪都回收起来，用以装备新组建的部队。到1939年，日本的军费支出已经达到了61.56亿日元，而1937年卢沟桥事变前日本的黄金储备和货币发行准备金加在一起都只有13.5亿日元！可以想象日本的经济已经窘困到了何种地步，在各种压力下日军在武汉会战后就只好将原来以军事打击为主的侵华政策逐渐转变为政治诱降为主、军事打击为辅了。同时国力和资源的提前消耗，也迫使日本走向了发动更大规模的太平洋战争的不归之路。这正是武汉保卫战在战略上胜利的意义所在。
