据档案资料显示，100部队利用老鼠进行细菌战的各项实验，用狗培植狂犬病菌，用马研究炭疽和鼻疽，用牛羊猪分别制造牛瘟、羊瘟和猪瘟，用鸽子进行病菌传染……然后疯狂地将这些病菌投放到无辜的居民区，对受害地区人民的生命财产造成了无法估量的伤害和损失。
原关东军司令部兽医处长高桥隆笃曾向梅津美治郎司令官汇报了100部队的生产能力："第100部队在一年内能制造的细菌数量是：炭疽热细菌1000公斤，鼻疽细菌500公斤，锈菌100公斤。"
一位长期从事100部队相关研究的专家透露，100部队的研究人员为了达到实验目的，除了在基地内进行实验外，还故意将一些受到细菌感染的动物赶往附近村庄和牧场，导致百姓的大批牲畜死亡。
据记载，1942年，100部队的军官和研究人员曾将12公斤鼻疽菌全部倒入中苏边境的德尔布尔河，以此作为演习的实验项目，造成了大量人畜死亡。
对动物的研究仅仅是其罪恶行径的"表面文章"。学者的研究证据表明，与731部队一样，100部队中也曾进行过大量人体实验。
