同年，南澳总兵李准带领3艘兵舰，前去西沙、东沙群岛巡视，在次要岛屿上"勒石为碑，宣示主权"。在巡视东沙时，发明日本人非法登岛，军方以及政府一壁派"飞鹰"舰再赴东沙，查清日本人侵占究竟，并拍摄照片为证，还采集包含英、法水兵的相干海图等无关东沙岛各类文献，连同"飞鹰"号拍摄的照片，急送北京内务部。呈文指出：日本人"私据有据，若没有想法争归，则列国必援均沾之例，争思攘占，所关非细"，但愿内务部"迅与日使交涉，饬将该国商平易近一概撤归，由我派员收管，另筹安插，一申主权"。
一壁踊跃备战，筹备武力发出东沙岛，并威慑其余国度"争思攘占"我国南海诸岛的贪图。李准理直气壮责问西泽："东沙群岛进中华邦畿已经有几百年，东沙主权始终在我，尔等何患上私占?"日本当局诡辩该岛是"无主荒岛"，中国则出示《国图柔遥记》《中国江海险峻图志》和中国以及英国出书的一些舆图力排众议，充实证实东沙群岛是中国疆域，属广东统领。日本事事在确实证据眼前张口结舌，只患上认可东沙岛为中国固有疆域。1909年10月11，中日两边签定了《东沙问题公约》，明确东沙群岛为中国固有疆域，日本人当即撤出，将东沙岛奉还中国，并赔偿中国渔平易近及毁坏庙产的丧失，向清当局补征税款。
