但1949年，中国发生翻天覆地的巨变。贝德士曾试图在他的宗教信仰与中国共产党的"为人民服务"中寻找共通之处，他觉得自己可以在新政权下继续从事教育和研究。1950年朝鲜战争爆发使一切成为泡影。作为金陵大学少数被"礼送"而不是被驱逐的美籍教师，他离开了工作30年的大学。费吴生在1940年甚至受邀访问延安。由于信仰和政治观点的不同，费吴生对共产党抱有成见，他早年在中国的事迹也便不再被提及。
1967年，费吴生撰写了一部回忆录《我在中国八十年》，在台湾出版。这部回忆录中详细记录了1937-1938年他在南京的亲身经历，时至今日还是指控大屠杀的有力证据。
