由于绝大多数与会者都反对蒋介石派兵入朝，尽管杜鲁门仍旧担心美国在朝战中能够使用的部队为数很少，但是他还是接受了多数与会者的意见，决定婉言谢绝蒋介石的请求。6月30日下午1时22分，参谋长联席会议向麦克阿瑟下达了84718号命令："兹取消84681号命令中关于限制使用陆军的规定"，授权麦克阿瑟可以使用他所指挥的陆军投入朝鲜的战斗，只是以"在目前情况下不危及日本的安全为限"。此外，"国务卿奉命通知，目前对蒋介石委员长提供部队的建议应予谢绝"。
杜鲁门的特别顾问哈里曼于8月6日专程赶到东京，当面告诉麦克阿瑟：总统希望"他绝不应该允许蒋介石成为发动对中国大陆的中国共产党战争的导火线，这样做的结果可能使我们卷入一次世界大战"。
麦克阿瑟意识到自己鲁莽的访台之举惹恼了杜鲁门。他的态度似乎有所转变，对哈里曼说："作为一个军人，将遵守总统的任何命令。"
麦克阿瑟还向哈里曼介绍了他和蒋介石会谈的情况，说自己和蒋介石的会谈仅限于军事方面的事务，涉及政治问题时就加以拒绝。麦克阿瑟还说，蒋介石曾提议把国民党军队交给自己指挥，而自己则回答蒋介石说这样做是不妥的，他可以提供军事方面的建议。麦克阿瑟还通过哈里曼建议杜鲁门不要把蒋介石"踢来踢去"，希望"总统想些办法来缓和国务院和委员长之间存在的紧张局势"。
麦克阿瑟虽然表面上接受杜鲁门的决定，但作为军方鹰派代表人物，他的性格使其自行其是，不听招呼。8月26日，麦克阿瑟给美国海外战争退伍军人协会主席发去一封长信，并向美国各报刊分发了长信的全文。信中重弹了台湾作为"不沉的航空母舰"的战略价值，暗示美国应当保卫并长期控制台湾，将来在战争时可以利用该岛作为美国的军事基地，等等。这与杜鲁门6月27日所谓"中立的"声明的步调明显不一致，用杜鲁门在回忆录中的话说，就是"他要采取一种以台湾为据点的军事侵略政策"。
美国对外只能有一个声音，那就是总统的声音。杜鲁门立即下令让麦克阿瑟收回他的讲话。在致麦克阿瑟的信中，杜鲁门再次强调了美国的态度："美国的行动对福摩萨岛上的军队和对大陆的军队同样是一种不偏不倚的中立行动。"1951年4月，杜鲁门果断地将桀骜不逊的麦克阿瑟撤职，以陆军参谋长助理李奇微代替他。
美国国务院和国防部在对台策略上虽然存在分歧，但是他们还是达成了妥协。8月底，杜鲁门批准了向台湾当局提供1.4亿美元军事援助的计划。美台关系日渐升温，但是蒋介石关于出兵朝鲜半岛的建议，此后却不在美国最高决策层的考虑之列了。
