1895年2月6日凌晨4时，来远舰在威海卫码头被日军第一鱼雷艇队偷袭，中雷两枚后翻转沉没。
来远舰沉没后，其残骸最终命运一直无人知道。中国海军史研究会现存截取来远舰舵轮制作的墨盒一枚。这件墨盒的发现，证明占领威海卫后，日军曾对来远舰进行过破坏性打捞，其舵轮应当就是此时被拆取的。这与日方记载将威海卫港内北洋水师沉船打捞权拍卖的记录是吻合的。事实上，水下勘探证明，威海卫港内沉没的北洋水师沉船船体，今天都已经不复存在了。
两舰现存遗物
经远舰：
●中国旅顺日俄监狱旧址博物馆现存该舰救生圈一枚。
●中国辽宁省庄河海区已发现疑似经远舰水下残骸，并打捞包括紫铜套管、钢板、炮台护圈、工具、炮弹等残件。
●中国民间收藏家存经远舰发出给上海叶观庭先生的信件一封。
