这家资料馆的建立反映了战后日本社会对战争责任的认识、反省和追究。资料馆前身是日本陆军1937年开设的登户研究所，曾设有生化武器、假钞制造等科目。在规模最大时，这里曾有约1000名工作人员和100余栋建筑物。1950年，明治大学买下研究所遗址。上世纪60年代，日本知名导演北野武以及演员西田敏行在该校区就读时曾参加学生运动，要求把这些战争遗迹保留下来。2004年前后，时任明治大学校长纳谷广美收到登户研究所前工作人员希望保留该遗址的信件后，经过6年的筹备，终于在2010年，把这座当年用于研究细菌武器的实验室改造为用于和平教育与研究的资料馆。
