武卫军-被中断的"国防军"
1898年10月，"新建陆军"被编为武卫军"前后左右中"五路中的武卫右军，直接受直隶总督兼北洋大臣荣禄节制。随机跟随袁世凯到山东去镇压义和团运动。在那里，袁世凯将三十四营旧军改编，命名为"武卫右军先锋队"，令武卫右军扩大至两万余人。
袁世凯的新建陆军被并入武卫军实际上是清末军事大改编的一部分。荣禄改编的这支军队，除了袁世凯部(武卫右军)外，还兼有了聂士成的武毅军(武卫前军)，宋庆的毅军(武卫左军)和董福祥的甘军(武卫后军)，又自己建立了武卫中军。这支武卫军囊括了当时中国几乎全部陆军精华。
这些部队不同程度上均采取了各种西式装备和体制，曾在甲午陆战成为不多亮点的聂士成，麾下的武卫前军主要还是采用淮军营制，但西化程度较高，步马炮工一应俱全，且也采用德、俄教习，在很多方面不输于右军，袁世凯本人对其也赞叹不已。
董福祥的后军则是完全依照左宗棠的楚军营制，系湘军中的老湘营一支营制的变种，后军有一定战斗力，装备略同左军。本身就来自淮军系统的宋庆的毅军营制与淮军相仿，缺少工程兵，在装备等方面比前、右两军稍逊色，但训练不差。荣禄自兼的武卫中军和后军关系较近，营制全仿后军，只有步、马两兵种，无炮兵，荣禄也是个使用国货的模范。
从今天来看，武卫军的成立，具有从旧式军队向近代国防军前进的趋向。但是其在庚子之乱中基本被打散，只有袁世凯部即武卫右军较好地保留下来，也就有了后来的北洋军。反过来说，如果没有庚子之乱，武卫军整合操练完成，就构成一支清政府中央直辖，能够被中央控制的强大武装(中央军、国防军等)，袁世凯也只会是诸多将领的一员，不可能后来一人独大，清王朝也许能得以暂时续命。
新军反噬推翻清朝
后甲午时代的清朝陆军重建在庚子之乱中进入了一个转折点，在《辛丑条约》后，随着武卫军体系的崩溃，全国开始进行全面彻底的淘汰旧军(防军、练军、绿营)，训练新军的工作。
宏观方略是以北洋新军为中央军、各省的新军为地方军，模仿日本的师团体制，全国共编练三十六个镇(师)，聘用德国教官，编练全新的现代军队，从编制、兵种、训练、武器装备、士兵的年龄和文化程度、军官的配备等，一律仿照德国军队模式编练。
到清朝覆亡的时候，全国已练成新军十六镇和十六个混成协(旅)，其中装备与训练为袁世凯的北洋六镇为最佳，遍布直隶、山东与东北。但这支军队的性质，也悄然发生了变化。其中北洋系新军约占全国新军总兵力的三分之二弱。北洋军各镇军官都是袁提拔起来的旧部， 他们"只知袁宫保， 不知大清朝"，变成了将领个人的私兵，也成为后来军阀的起源。
其余的南方新军，因为一些开明地方大员如张之洞、端方等注重招收有文化的青年入伍，和招收留学生任军官如蔡锷、阎锡山、许崇智等，这些知识青年读过书见识广，敢于持有不同政见。同时革命党人如黄兴、宋教仁等注重开展兵运，秘密向新军中输送革命分子，如吴禄贞、赵声、孙武等。这些军内革命党人待命伺机发动起义。
武昌起义前全国新军约有24.1万人， 其中北洋系14.5 万人，南方新军9.6 万余人。自武昌新军起义后，在全国新军14镇、18 混成协、4 标中， 先后反正、解散、溃败的新军约有7镇、10协、3标。南方各省的新军， 基本上都加入到反清的革命队伍之中。除上海、广东、广西辛亥革命起义是以民军商团为主之外，其他各地起义均为新军起义为主。所以某种程度上，清政府也是被自己的新陆军所推翻的。
