在萧亚轩最红时曾与三线演员隆宸翰拍拖，但二人恋情的终结方式竟然是男方出轨，且出轨对象是萧亚轩的好朋友。此外，萧亚轩的绯闻男友还包括巴西混血男模李安卓、资深艺人比莉的儿子周汤豪，与柯震东的恋情是近年最轰动的，二人自2012年初传出"亚东恋"，两人恋情维持了两年，直到2014年3月分手，分手后的二人一度关系紧张，甚至连朋友都做不成。
萧亚轩事后透露分手内幕，坦言曾经为这段感情很努力，只是自己太有主见，无法做小女人，因两人的生活跟价值观落差太大才决定放弃。
