柯文哲的大伯毕业于台大医学系，他的父亲起初也考取该系，不过由于家贫改读公费的新竹师范专科学校;柯文哲的妻子是他台大医学院的院友，弟弟是台湾交通大学资讯管理博士，妹妹则是台大医学院生理所博士。
不过也有一些县市长仅有专科学历，如宜兰县长林聪贤、南投县长林明溱、新竹县长邱镜淳等。台湾的医师地位很高，一些人便因势利导走上政治道路，新一届县市长中有4位有学医经历，包括柯文哲、涂醒哲、赖清德、刘增应。
