反服贸运动使得两岸经贸往来遭到巨大挫折，至今两岸经贸关系进展仍处于"冻结"状态。尽管，台湾当局对两岸经贸关系忧心忡忡，不过台湾方面也并未采取有效措施，积极推动双方经贸往来的发展。台湾地区领导人马英九此前指出，在整个亚洲签署自由贸易协议或参与区域经济整合上，台湾的成绩是非常落后的。
不过，马英九在10月31日接受美国媒体专访时却声称，他支持香港学生"占中"。但他认为这与反对今年春台湾爆发的反对两岸服贸协议的太阳花学运，在立场上并无抵触，因为他"欢迎民主，反对暴力"。马英九一边力挺香港"占中"，另外一边争取大陆"服贸"协定。这样的行事方式能否实质性推动两岸经贸合作，还有待进一步观察。
