第三个层面的影响是产业合作方面。中韩FTA其实只是中韩经济架构的一部分，依据今年7月中韩领袖"联合声明"中"扩大面向未来的战略性经贸和产业合作"的共识。中国工信部已经和韩国产业通商资源部共同签署"产业合作谅解备忘录"，合作领域涉及工业政策、节能减排、汽车、钢铁、船舶和海洋工程设备、机械、新材料、石化、IT制造等多个方面。
中韩产业合作不但将增强韩国企业在中国市场的竞争优势，中韩在战略性新兴产业的合作势必将提升中韩产业在未来全球市场的竞争优势，自然会影响台湾的产业发展。台湾大学经济系教授林建甫说，根据韩国自己的评估，中韩FTA比韩美FTA和韩欧FTA的影响还大。三星研究所的研究说，中韩FTA会使韩国的GDP增长2.72%，韩美FTA只让韩国增长0.56%，韩欧FTA让韩国增长1.62%。
