随着马任期越来越接近尾声，马对历史定位的寻求，也越来越让美国感到担忧。问题是，不管是两岸和平协议或两岸军事互信机制，所牵涉的都太敏感，美国因此判断马最可能做出的两岸政治突破.就是在太平岛合作上表达善意，但这显然严重违反了美国重返亚太、制衡中国大陆南海扩张的布局。
菲律宾早在2013年1月就将黄岩岛争议提交国际法庭仲裁，结果很可能在今年12月宣布，由于国际法庭庭长柳井俊二是日本前驻美大使，一般认为裁定将有利菲律宾。中国大陆很可能拒不接受，势将引发针对"九段线"的国际舆论战，美国当然不希望台湾成为大陆"九段线"论述的盟友。就在与南海有关的国际争议日益加深之际，台湾宣称拥有"U形线(九段线)"内四大岛群及周边水域的"主权"。但这样的表态遭到一些前美国官员的批评，称该主张不合法、不实际且毫无理性基础。
