但是，实现两岸统一历来面临巨大的挑战，在此也不妨一一列出。第一，来自国民党之"党国"的挑战。国民党之"党国"历来将自己视为中国的正统，它过去是主张统一的，有武力统一，口号是"反攻大陆";有政治统一，口号是"三民主义统一中国"。马英九当政后提出了"三不"主义，即"不统、不独、不武"，把统一问题搁置了起来。
后来虽然有了"新三不主义"，即：不去推动"两个中国"，不会推动"一中一台"，不会推动"台湾独立"，但统一的话题莫再提起，事实上等于搁置了起来。总之，国民党的"党国"骨子里是排斥与共产党大陆统一的，如果国民党愿意统一，两岸统一问题将迎刃而解;如果国民党抱着以托待变的侥幸心理，两岸统一仍然缺少起码的政治基础。
