但审计部门却发现，洋巡总局在舰艇上的20机炮，有4个海巡队近两年根本未曾实弹射击;巨资所建构新舰，飞行甲板却无法让黑鹰直升机降落，机库停不进直升机，相当离谱。审计部门送到"立法院"的总决算审核报告中指出，空勤总队有10架AS-365海豚直升机，军方未来移拨空勤总队的15架黑鹰直升机，其中也有6架规划用于海上救难。而黑鹰直升机机身长度19.76米，但"海巡署"兴建8艘新舰中，除两艘3000吨救难舰有24.5米的飞行甲板可停降黑鹰，其余1000、2000吨级舰飞行甲板，仅17.9到19米，长度不足，黑鹰直升机无用武之地。
审计部门还指出，海豚机旋翼片长11.94米，海巡3000吨级救难舰机库宽度只有6米，直升机旋翼要折迭才能进机库，但空勤总队不会折迭旋翼，没训练，也没工具，3000吨级巡防救难舰机库有虚设疑虑。而据指出，"海巡署"2000吨级巡防舰直升机库，同样面临这个问题。
