早年S-2T由海、空军人员共同操作,正、副驾驶为空军人员,而2名侦潜官则由海军派任。1998年7月1日,空军439联队第33、34中队所属S-2T和空地勤人员正式改隶海军航空第1大队;1999年8月25日,海军航空指挥部正式编成,反潜指挥体系由海军统筹管理。