由于"新北舰"未来护渔任务的范围涵盖东北角海域，"外交部"事先对马英九出海护渔是否将再次冲击近期逐渐缓和的台日关系做过一番评估，最后决定将本次出海定调为海巡例行业务，"淡化外交及宣示主权意涵"。《联合报》猜测，马英九很可能重申"东海和平倡议"主张，而且此行是他自去年9月7日在彭佳屿公开发表谈话后，又一次以台湾领导人的身份宣示"保疆护渔"决心，"可能再次引起包括日本在内的周边国家注意"。
