而反辐射导弹方面，歼-16改进型飞机可能会继续采用国产YJ-91反辐射导弹，YJ-91是国内引进的KH-31P反辐射导弹，采用固体冲压发动机，射程可以超过150公里，由于采用了固体冲压发动机，工作时间长，因此导弹在整个射程范围之内具备较高的平均速度，可以对付机动目标和移动目标，适合攻击和压制宙斯盾这样的移动辐射目标。
挂载国产电子战吊舱执行任务的歼轰-7
歼-16电子战改进型虽然取消了航炮，但是挂架可能都会保留，其通常挂载方式可能是3个电子干扰吊舱、2枚YJ-91反辐射导弹和2枚自卫用空空导弹。
歼-16电子战改进型的研制，有效的提高中国空军的电子战能力，有消息说中国海军航空兵可能也会利用相关设备来改装歼-15S的电子战改进型，至于未来的发展，可能依照EA-18G发展路线图，利用国内在有源相控技术方面的进步，研制新一代干扰吊舱，同时研制新一代反辐射导弹，或者将YJ-91升级为被动制导/红外成像复合制导，以进一步提高中国空军和海军航空兵的电子战能力。
