李宗仁当选副总统后，白崇禧出任华中"剿总"司令长官，总部设在武汉。武汉行辕随之撤消，程潜于1948年7月回湖南任长沙绥靖公署主任兼湖南省主席。8月10日，他在省政府宣誓就职。
程潜一回到湖南，就抓紧扩充军队，编训新兵。此时，程潜与蒋介石及桂系的矛盾也日渐加深。蒋介石企图利用程潜牵制桂系，在他身边安插了一批亲信以作监视。1949年1月，桂系逼蒋介石下野，李宗仁代理总统。此时，李宗仁、白崇禧仍企图凭借长江天险，与共产党隔江而治。但程潜已决意走和平道路，他派族弟程星龄与中共地下党取得联系。
1949年8月4日，湖南38名高级将领，由程潜、陈明仁领衔发表起义通电。次日，解放军进入长沙，湖南和平解放。
对于另一个"接班人"孔祥熙，蒋介石其实未做太多考虑。国民政府时期的财政部长，基本上是孔祥熙和这个宋子文轮流做。孔祥熙是蒋介石，可以说是最信任的一个行政院长，或者是财政部长。蒋介石和宋子文矛盾很深，他经常在他的日记里边大骂宋子文跋扈，少年得志，甚至于说宋子文居心不良。所以蒋、宋关系不好，但是蒋孔关系却很好。而且当重庆的国民参政会揭露孔的贪污罪行的时候，蒋介石也很维护孔祥熙。
