不久，郦琼叛变投敌，张俊引咎辞职，秦桧接任枢密院事，接着又担任了宰相。秦桧是主和派的领袖，受到高宗的信任，一直与金人周旋，力图创造和议局面。这样，一心想依靠作战收复河山的岳飞与秦桧之间不断发生摩擦。绍兴九年(1138年)，当秦桧声言和议已取得进展，金人将归还南宋三京及河南之地时，岳飞上奏章反对说："金人不可相信，和议不可依赖。相国(指秦桧)为国家谋划不善，恐怕为后世留下笑柄。"皇帝看了岳飞的奏章后，便将和议之事搁下，秦桧因此对岳飞恨得咬牙切齿。
绍兴十年(1139年)岳飞率大军北伐，郾城一战，消灭了金兀的骑兵主力，接着又取得朱仙镇大捷。他打算乘胜前进，一举收复中原。然而，南宋朝廷上下对岳飞的胜利却忧心忡忡，高宗急令岳飞班师，并一连下了十二道金牌。岳飞抗争不过，悲愤地仰天长叹："十年之功，毁于一旦!"翌年，金兵入侵江淮，高宗又急忙诏岳飞赴江州救援。
岳飞却迟迟不肯发兵，他提出要乘金人后方空虚，准备直捣中原。高宗为此竟连下十七道文书，岳飞不得已才出兵救援。朝廷上下对岳飞的抗旨没有谁能阻止这一切的发生，因为在秦桧的背后，是整整一个王朝制度。
