他针对陈水扁时期将抗战史从台湾剥离的言论说，"不可讳言，抗战历史在台湾似乎有被淡化的情况"，但"没有七七抗战，就没有台湾的光复。"马英九也承认，为赢得胜利，国共双方都付出了巨大牺牲，包括捐躯的204名国民党将领和2名共产党将领。⑤
2014年9月3日秋祭，依惯例，由"总统"马英九主祭，"副总统"、"五院院长"等出席。此次秋祭，马英九等除为阵亡将士上香、献花外，还首次祭拜了远征军英灵。
