1904年日俄战争爆发，18岁的菊子潜入西伯利亚充当妓女，获取了大量俄军重要情报，在日本情报界初露锋芒。
1918年，日本伙同一些帝国主义国家出兵西伯利亚，占领了俄远东地区的一些城市，对俄国革命实施武装干涉。为消灭苏俄红军，扶持傀儡政权，日军在远东广设特务机关，由于山本菊子精通汉语、俄语和朝鲜语三门语言，于是便被派往中俄边境一带活动。
她几乎走遍西伯利亚和中国东北地区，与白俄匪军和中国东北的马贼相互勾结，搜集到苏俄红军的许多重要情报，"西伯利亚阿菊"的大名逐渐响亮起来。
后来，白俄匪军被红军击败，25万残匪退入中国东北地区。日本特务头子土肥原贤二看中了这股力量，于是他命令山本菊子设法拉拢白匪头子谢苗诺夫，拉几万白俄残匪到哈尔滨、大连一带，为日本侵略中国服务。
