这些弹药库通常设置在舰岛的前方。航母上的弹药库可以分为主弹药库、导弹弹药库、战备勤务弹药库和储存特种弹药及其部件的弹药库。
重要的弹药被放在水线以下的位置，而且有装甲室提供保护。此外，在弹药库的外侧，航母通常还设置了水下防护结构。舰船水线以下部分遭到攻击，受致命伤的概率高得多，这也许是许多国家仍然不愿意放弃鱼雷的重要原因之一。
航母的弹药库布置结构。其中，粗斜线部分用于放置普通弹药，中斜线部分用于放置火工品、小斜线部分用于放置炸弹，小点部分被用于放置火箭弹，反粗斜线部分被用于放置导弹。竖线是人员进入弹药库的路线。由于弹药库设置在船体的下方，反舰导弹必须有足够强大的威力和穿甲性能。配备穿甲战斗部的东风-21D和东风-26型导弹末端速度极高，弹头质量巨大，可以胜任这种任务。
