航空电子系统方，歼-16取消了空束管，相信和歼-10C、歼-11D一样，加装了有源相控阵雷达，有源相控阵雷达探测距离远、功能强，尤其利用多波束能力可以同时实现空空/空地模式。
例如在地形跟踪飞行的时候，仍旧保持对空中目标的探测，超视距空空导弹方面可能会采用配备双脉冲固体火箭发动机的PL-12改进型主动雷达制导空空 导弹，从而有效的增强了飞机的超视距空战能力，完全可以对抗配备最新配备的阵风F3战斗机，也就是印度空军采购的版本，配备有源相控阵加流星空空导弹。
近距空战武器方面 ，歼-16采用了新型翼尖挂架，说明它可能配备国产PL-10红外成像空空导弹，配合国产头盔显示/瞄准系统，具备更大角度的离轴攻击能力，目前第四代红 外成像格斗空空导弹在我国周边国家和地区扩散非常明显，所以PL-10的配备提高歼-16与这些作战飞机的进行近距格斗的能力。
