日本自卫队和美军还制订了假想钓鱼岛"有事"的共同作战研究方案。这个由防卫省的统合幕僚监部与驻日美军司令部的官员共同制订的方案，将作战分为四个阶段。分别是：第一阶段，为防止"敌方"登上钓鱼岛，强化舰艇和飞机在周围的警戒;第二阶段，敌方小规模的武装势力登陆后，日美阻止敌方增援部队靠近并切断其补给途径;第三阶段，对于已登陆的力量用炮火、空袭等进行总攻;第四阶段，日美部队登陆并夺回岛屿。按照《日美防卫合作指针》，以自卫队实施"主体性行动"，美军"适当配合"的原则具体实施。
日本防卫省下属的防卫研究所研究人员透露，为应对台海危机及东海等周边"有事"状态，日本将加快建立离岛遭受武力攻击的应对体制，加快培养离岛登陆和夺取作战的专业部队人员，日本将在2016年度末建立教育队，2017年度末将在神奈川县建立统一指挥美日陆上部队的联合司令部。针对频繁进入钓鱼岛及其附近海域巡航的中国公务船，日本意在加强本国威慑力。
