转折点出现在1996年，中俄哈吉塔五国元首在上海创建上海五国会晤机制(上合组织前身)。中国也是首个签署全面暂停核试验的联合国安理会成员，此举大大改善了与哈的关系。
本世纪初，中国对哈军事援助转向合作打击分裂主义和伊斯兰极端主义。"9·11"后，两国高层承诺共同打击恐怖主义。中国对哈的支持表现在向其军方捐赠通信设备和其他科技产品。哈逐步转向中国，则有稀释俄罗斯对其安全垄断的考虑。
中哈10月份所签军事协议的焦点是应对非对称战争。中国同意与哈合作特种部队训练，协助提高其军队应对城市、山地和海上环境下的战争。正如不久前欧亚网一篇文章所言，这种训练以前是以上海合作组织的名义进行，如今的双边演练是耐人寻味的新情况。
然而，尽管中哈间实际军事合作加深，两国在安全问题上的双边协作仍有限。过去20年里，入读中国军校的哈学员据估计只有100人。哈军事人员也不太熟悉中国的军事装备。另外，中国军队在中亚的军事影响力仍有限，哈继续依赖进口俄供应商的装备。因此，尽管中国对哈经济影响力大增，但并没因此转化为对哈安全政策的更大主导。
