潜艇也是2015财年的投入重点，日本计划拨出643亿日元，建造第11艘4000吨级的"苍龙"级AIP潜艇。"苍龙"级潜艇加装了AIP系统，噪声更低、战力更强，可在水下连续潜航2～3周，能在整个东亚海域进行攻势部署。
值得关注的是，日本潜艇技术先进、自动化程度高，但其单艇编配艇员却多达70人，这极有可能是在储备艇员，日本完全有条件在2020年装备22艘高性能潜艇，甚至在2030年将潜艇数量提高到30艘，成为影响战争结局的关键力量。
