在下一次的作战计划制定中，2015年4月修改的新《美日防卫合作指针》与安全保障相关法的内容将首次得到全面反映。在制定作战计划前需要通过3个步骤，以前各机构的作用分担为(1)内局运用企划局决定规定基本方针的防卫相指针(2)统合幕僚监部根据该指针制作作战计划(3)运用企划局向防卫相请求批准。
但由于运用企划局已于2015年被废除，日本自卫队的作战指挥也由统合幕僚监部"一元化"控制，统合幕僚监部主张"制定作战计划也都属于统合幕僚监部的权限"，还要求内局方面转让(1)与(3)的权限。
另一方面，内局方面主张"作战指挥与作战计划不同"。此外，日防卫省设置法的第8条规定"防卫及警备相关工作的基本与调整"、"自卫队行动相关事务的基本"由内局负责。内局还以具有综合调整职能为依据，反驳称(1)与(3)的工作应当由继承运用企划局部分职能的内局防卫政策局继续担任。
