台湾《旺报》1月31日评论称，美军舰此次选择西沙中建岛，并刻意点名"中国、台湾、越南"三方，时间点正值马英九登上太平岛之后，越共选出新领导班子，被视为"亲中"的阮富仲续任总书记，令人不免联想美国有意借此提醒盟友、警告大陆。报道称，"从美方公开点名三方，特别是指明台方，更凸显美真的担心两岸连手护南海"。岛内也有分析称，美国此次将台湾与越南和中国大陆并列为"声索方"，可能是为了拉拢台湾。
马英九1月28日登太平岛之前，美国在台协会发言人曾表示"非常失望"，登岛"极无助益"。但看上去这难以压服台湾。台湾海洋大学学者谢立功1月31日在岛内媒体上撰文呼吁未来的台湾政治人物"一棒接一棒，南海主权绝不退让"。
